Ο Φάνης Μουρατίδης, έκανε την πρώτη του εμφάνιση στην τηλεόραση το 2000 με έναν μικρό ρόλο στη σειρά Γεώργιος Βιζυηνός: Η σιωπή των αγγέλων. Έγινε γνωστός στο ευρύ κοινό το 2004, όταν πρωταγωνίστησε μαζί με τον Κωνσταντίνο Μαρκουλάκη, τον Αιμίλιο Χειλάκη και τη Βικτώρια Χαραλαμπίδου στη δραματική σειρά Έτσι ξαφνικά, σε σενάριο της Μιρέλλας Παπαοικονόμου. Μετά το τέλος της σειράς δέχτηκε αρκετές προτάσεις για τηλεοπτικές σειρές.
Η επόμενη εμφάνισή του στην τηλεόραση ήταν το 2005, συμμετέχοντας σε ένα επεισόδιο της κωμικής σειράς Safe Sex TV Stories. Ακολούθησε μια ιστορία στη σειρά The Red Room, όπου πρωταγωνίστησε στο πλευρό της Πέμης Ζούνη. Τη σεζόν 2005-2006 πρωταγωνίστησε στην κοινωνική σειρά Επάπι, ακολούθησε η σειρά Φύγε, έλα εσύ με κωμικό ρόλο και η δραματική σειρά, που είναι η βιογραφία της Έλλης Λαμπέτη, Η τελευταία παράσταση. Τη σεζόν 2007-2008 πρωταγωνίστησε με την Άννα-Μαρία Παπαχαραλάμπους στην κωμική σειρά Daddy Don't Run, κατά τη διάρκεια των γυρισμάτων της οποίας έγιναν ζευγάρι και απέκτησαν το πρώτο τους παιδί. Ακολούθησε μια guest εμφάνιση στη μαύρη κωμωδία Ποιος μας πιάνει το 2008 και το 2009 εμφανίστηκε στην ταινία Επτά θανάσιμες πεθερές και δύο ιστορίες στη σειρά Working Woman. Από το 2009 έως το 2010 πρωταγωνίστησε μαζί με την Παναγιώτα Βλαντή στην κωμική οικογενειακή σειρά M+M. Το 2011-2012 έκανε κάποιες cameo εμφανίσεις στην κωμική σειρά Clinical Case ενώ το 2014-2015 εμφανίστηκε σε κάποια επεισόδια της σειράς Modern Family. Το 2018 πρωταγωνίστησε μαζί με τη Φιόνα Γεωργιάδη στην ερωτική τηλεοπτική ταινία The Taste of Love.
Από το 2018 έως το 2020 πρωταγωνίστησε στην κωμική σειρά Πέτα τη Φριτέζα στο πλευρό του Γιάννη Μπέζου και του Γεράσιμου Σκιαδορέση, ενώ τη σεζόν 2020 - 2021 πρωταγωνίστησε στη σειρά Έρωτας με τη διαφορά. Τη σεζόν 2022 εμφανίστηκε στη σειρά Μαέστρος στο MEGA.
Κινηματογράφος
Το 2003 έκανε την πρώτη του εμφάνιση στον κινηματογράφο με πρωταγωνιστικό ρόλο στην ταινία Wedding Dope. Το 2006 συμμετείχε σε δύο κινηματογραφικές παραγωγές. Αφενός πρωταγωνίστησε στο πλευρό του Βασίλη Χαραλαμπόπουλου και της Παναγιώτας Βλαντή στην ταινία Πέντε λεπτά παραπάνω, ενώ την ίδια μέρα συμμετείχε στην ταινία μικρού μήκους Το κορίτσι. Το 2008 ακολούθησε ένας μικρός ρόλος στην ταινία Bank Bang, ενώ το 2009 πρωταγωνίστησε στο πλευρό της Ελένης Ράντου στην ταινία που έγραψε η ίδια με τίτλο Πεθαίνω για σένα. Ακολούθησε το 2012 η ταινία του Χριστόφορου Παπακαλιάτη με τίτλο Αν... το 2012.
Οι επόμενες κινηματογραφικές του εμφανίσεις ήταν στις ταινίες Amore mio το 2015 και Jamaica το 2017.
Για τη συμμετοχή του και τη συνεργασία του με τον Χριστόφορο Παπακαλιάτη και την ομάδα του στη σειρά του Netflix Maestro in Blue δήλωσε σε πρόσφατη συνέντευξή του: "Αυτό που δεν θα ξεχάσω ποτέ είναι η συνεργασία μας και ειλικρινά, ήταν μοναδική. Ξεκινάει πάντα από το πρόσωπο που δίνει το ρυθμό του έργου και εδώ ο Χριστόφορος είναι κυριολεκτικά ο μαέστρος, γιατί στα ιταλικά, στη νεορεαλιστική εποχή, ο σκηνοθέτης λεγόταν μαέστρος. Αλλά εδώ ο Κρίστοφερ δεν είναι μόνο σκηνοθέτης, είναι μια ορχήστρα από μόνος του. Είναι στη δουλειά από το Α έως το Ω, οπότε έχει τεράστια ευθύνη για τις δημιουργικές συνθήκες που έχει δημιουργήσει για να δώσουμε όλοι μας το 100% του εαυτού μας. Και όταν κάποιος φροντίζει τις συνθήκες τόσο προσεκτικά, όλοι οι συνεργάτες και πίσω από την κάμερα είναι ευχαριστημένοι με αυτό που κάνουν, νιώθουν ότι είναι μέρος ενός οράματος που αγγίζει τις προσδοκίες του.
